微波干燥殺菌設備利用微波的熱效應和非熱效應共同結合而工作，能使物料內外迅速升溫，同時(shí)其對生命體的有機阻斷作用，在對物料干燥的同時(shí)，從低溫開(kāi)始就有殺菌的功能，這種設備具有節能環(huán)保的特點(diǎn)，微波干燥（滅菌機）的物料不變形，不改變顏色，不破壞原有成分并能有效延長(cháng)保質(zhì)期。

微波干燥殺菌設備用于粉狀、顆粒、片狀等食品、藥品、營(yíng)養品、糧食制品、農副產(chǎn)品、殺菌、醬菜、鹵味、各種肉制品小包裝的防霉、殺菌、保鮮。微波殺菌是利用了電磁場(chǎng)的熱效應和生物效應的共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質(zhì)變化，使細菌失去營(yíng)養，繁殖和生存的條件而死亡，對于大腸桿菌群等致病菌具有獨特的殺菌效果。

微波滅菌的機理在于，細菌、成蟲(chóng) 與任何生物細胞一樣，是由水、蛋白質(zhì)、核酸、碳水化合物、脂肪和無(wú)機物等復雜化合物構成的一種凝聚態(tài)介質(zhì)。其中水是生物細胞的主要成分，含量在 75～85％，因為細菌的各種生理活動(dòng)都必須有水參與才能進(jìn)行，而細菌的生長(cháng)繁殖過(guò)程，對各種營(yíng)養物的吸收是通過(guò)細胞膜質(zhì)的擴散、滲透和吸附作用來(lái)完成的。在一定強度微波場(chǎng)的作用下，物料中的蟲(chóng)類(lèi)和菌體也會(huì )因分子極化馳豫，同時(shí)吸收微波能升溫。由于它們是凝聚態(tài)物質(zhì)，分子間的作用力加劇了微波能向熱能的能態(tài)轉化。從而使體內蛋白質(zhì)同時(shí)受到無(wú)極性熱運動(dòng)和極性轉動(dòng)兩方面的作用，使其空間結構變化或破壞，而使蛋白質(zhì)變性。蛋白質(zhì)變性后，其溶解度、粘度、膨脹性、滲透性、穩定性都會(huì )發(fā)生明顯的變化，而失去生物活性。另一方面，微波干燥殺菌設備的非熱效應在滅菌中起到了常規物理滅菌所沒(méi)有的特殊作用。也是造成細菌死亡的原因之一。