微波殺菌設備能夠很大程度的保持食品物料的營(yíng)養成分，殺菌效果顯著(zhù)，可以使食品不添加防腐劑而延長(cháng)保存期。微波殺菌技術(shù)的優(yōu)勢逐漸受到人們的中式，應用也遍及糧油制品、調味品、禽肉制品、豆制品和奶制品、果蔬殺菌保鮮、水產(chǎn)品等方面。

一般糧油制品的貨架期都比較短，因其含有大量的營(yíng)養物質(zhì)，易滋生細菌而腐敗變壞。一般的常規加熱殺菌中，食品內部的細菌很難被殺死，從而導致其貨架期變短且品質(zhì)下降。微波殺菌設備具有極強的穿透性，能將制品表面和內部的細菌殺死，而使其保鮮期增加數倍。

微波殺菌技術(shù)在果蔬保鮮方面的應用主要有兩個(gè)作用：殺菌和滅酶。果蔬品在采摘、運輸和加工過(guò)程中，不可避免地會(huì )收到一些機械損傷，由于細菌和酶的作用會(huì )使果蔬很快失去營(yíng)養價(jià)值和市場(chǎng)價(jià)值。若采用熱力殺菌方法，產(chǎn)品經(jīng)過(guò)高溫長(cháng)時(shí)間處理后，其風(fēng)味和口感變差。利用微波殺菌在短時(shí)間內既可以殺死細菌同時(shí)還可以使酶失活，并且保持了果蔬的價(jià)值。

肉制品的殺菌一般采用高溫高壓殺菌，殺菌時(shí)間長(cháng)，能耗大，營(yíng)養成分和風(fēng)味物質(zhì)損失大，而利用微波殺菌不僅速度快，效果好，而且能較好地解決軟包裝肉制品的殺菌問(wèn)題。

微波殺菌設備現在已經(jīng)廣泛應用于液體食品，如乳制品、果蔬汁飲料、啤酒、調味品等。液體食品容易發(fā)生霉變和細菌含量超標現象，微波殺菌具有溫度低、速度快的點(diǎn)，既能殺滅飲料中的各種細菌，又能防止其貯藏過(guò)程中的霉變。